Fodlan, 1188.

Trois ans après la fin de la guerre, Edelgard mène d'une poigne de fer le continent, de nouveau réuni. Cependant, tout est loin d'être fini. De nouvelles menaces font rage dans le nouveau continent : les serpents des ténèbres, originalement appelés les Aghartans, que l'on pensait définitivement exterminés semblent être au final vivants en petit groupe. De plus, comme si cela ne suffisait pas, les Nabatéens, une ancienne civilisation, descendants de la Déesse Sothis semblent également se réveiller et apparaître. Ces deux risques majeurs pour l'Impératrice s'ajoutent aux rumeurs infondées ou pas. L'une stipulait que Claude préparerait un coup tout en étant en Almyra. L'autre affirmerait que Dimitri a été aperçu vivant, alors qu'il avait été tué. La troisième et dernière parlerait des tensions entre les différentes nations entourant Fodlan, qui sont contre le nouveau gouvernement, et s'allient avec ceux qui ont combattu contre Edelgard et son armée.

Alors que Fodlan semblait, d'un point de vue extérieur, retrouvé son calme après la guerre, il n'était rien au final. De terribles menaces s'abattent à nouveau sur le continent.

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Ainsi, même si la paix semblait avoir repris de son cours dans Fodlan, ce n'était pas le cas. Préparez-vous, une nouvelle guerre s'annonce. De quel camps seriez-vous ? Des Nabatéens ? Des Aghartans ? Ou des humains ? Pour quelle noble cause choisisseriez-vous de combattre ? Surtout, n'oubliez pas, il y a des rumeurs qui surgissent et des agissements dans l'ombre...  Rejoignez-nous dans une guerre sans pareille pour un Fodlan qui s'entre-déchire dans l'ombre ! Choisissez d'incarner un peuple ancien ou récent et battez-vous pour vos idéaux !